Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYBPC1Q00872 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MYBPC1Q00872 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms