Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIM1P81133 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIM1P81133 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIM1P81133 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIM1P81133 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIM1P81133 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIM1P81133 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIM1P81133 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIM1P81133 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIM1P81133 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIM1P81133 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIM1P81133 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIM1P81133 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIM1P81133 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIM1P81133 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIM1P81133 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIM1P81133 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIM1P81133 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIM1P81133 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIM1P81133 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIM1P81133 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIM1P81133 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIM1P81133 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIM1P81133 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIM1P81133 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIM1P81133 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIM1P81133 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIM1P81133 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIM1P81133 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIM1P81133 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIM1P81133 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIM1P81133 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIM1P81133 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIM1P81133 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIM1P81133 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIM1P81133 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIM1P81133 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIM1P81133 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIM1P81133 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIM1P81133 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIM1P81133 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIM1P81133 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIM1P81133 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIM1P81133 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIM1P81133 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIM1P81133 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIM1P81133 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIM1P81133 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIM1P81133 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIM1P81133 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIM1P81133 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIM1P81133 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIM1P81133 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIM1P81133 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIM1P81133 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIM1P81133 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIM1P81133 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIM1P81133 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIM1P81133 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIM1P81133 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIM1P81133 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIM1P81133 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIM1P81133 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms