Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRPXP78539 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRPXP78539 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRPXP78539 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRPXP78539 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRPXP78539 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRPXP78539 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRPXP78539 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRPXP78539 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRPXP78539 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRPXP78539 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRPXP78539 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRPXP78539 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRPXP78539 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRPXP78539 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRPXP78539 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRPXP78539 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRPXP78539 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRPXP78539 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRPXP78539 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRPXP78539 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRPXP78539 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRPXP78539 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRPXP78539 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRPXP78539 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRPXP78539 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SRPXP78539 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRPXP78539 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRPXP78539 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRPXP78539 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SRPXP78539 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRPXP78539 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRPXP78539 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRPXP78539 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRPXP78539 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRPXP78539 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms