Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTG1P63261 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ACTG1P63261 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms