Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms