Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA6P60900 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA6P60900 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms