Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP4BP1P59074 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMP4BP1P59074 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP4BP1P59074 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms