Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF3BP55884 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3BP55884 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms