Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELLP55199 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELLP55199 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELLP55199 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELLP55199 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELLP55199 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELLP55199 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELLP55199 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELLP55199 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELLP55199 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELLP55199 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELLP55199 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELLP55199 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELLP55199 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELLP55199 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELLP55199 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELLP55199 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELLP55199 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELLP55199 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELLP55199 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELLP55199 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ELLP55199 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELLP55199 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELLP55199 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELLP55199 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELLP55199 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELLP55199 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELLP55199 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELLP55199 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELLP55199 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELLP55199 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELLP55199 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELLP55199 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELLP55199 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELLP55199 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELLP55199 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELLP55199 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELLP55199 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELLP55199 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELLP55199 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELLP55199 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELLP55199 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELLP55199 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELLP55199 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELLP55199 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELLP55199 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELLP55199 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELLP55199 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELLP55199 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELLP55199 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELLP55199 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELLP55199 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELLP55199 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELLP55199 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELLP55199 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELLP55199 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELLP55199 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELLP55199 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELLP55199 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELLP55199 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELLP55199 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELLP55199 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms