Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN5P54829 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN5P54829 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms