Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRAP54198 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRAP54198 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRAP54198 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRAP54198 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRAP54198 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRAP54198 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRAP54198 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIRAP54198 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIRAP54198 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIRAP54198 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HIRAP54198 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIRAP54198 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIRAP54198 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIRAP54198 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIRAP54198 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRAP54198 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRAP54198 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRAP54198 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRAP54198 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRAP54198 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRAP54198 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRAP54198 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRAP54198 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRAP54198 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRAP54198 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HIRAP54198 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRAP54198 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRAP54198 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRAP54198 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRAP54198 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRAP54198 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRAP54198 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRAP54198 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRAP54198 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRAP54198 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRAP54198 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRAP54198 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRAP54198 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRAP54198 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRAP54198 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRAP54198 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRAP54198 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRAP54198 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRAP54198 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRAP54198 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRAP54198 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRAP54198 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRAP54198 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRAP54198 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRAP54198 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRAP54198 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRAP54198 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRAP54198 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRAP54198 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRAP54198 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRAP54198 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRAP54198 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRAP54198 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRAP54198 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRAP54198 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRAP54198 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRAP54198 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIRAP54198 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HIRAP54198 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRAP54198 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRAP54198 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRAP54198 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRAP54198 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRAP54198 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIRAP54198 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRAP54198 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRAP54198 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRAP54198 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRAP54198 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRAP54198 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRAP54198 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRAP54198 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRAP54198 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRAP54198 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIRAP54198 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRAP54198 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRAP54198 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRAP54198 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRAP54198 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRAP54198 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIRAP54198 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRAP54198 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRAP54198 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRAP54198 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRAP54198 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRAP54198 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRAP54198 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRAP54198 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRAP54198 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRAP54198 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRAP54198 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIRAP54198 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIRAP54198 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HIRAP54198 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms