Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLNS1AP54105 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms