Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMTNP53814 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMTNP53814 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMTNP53814 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMTNP53814 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMTNP53814 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMTNP53814 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMTNP53814 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMTNP53814 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNP53814 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNP53814 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNP53814 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNP53814 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNP53814 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNP53814 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNP53814 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMTNP53814 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNP53814 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNP53814 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNP53814 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNP53814 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNP53814 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMTNP53814 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMTNP53814 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMTNP53814 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMTNP53814 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMTNP53814 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMTNP53814 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMTNP53814 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMTNP53814 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMTNP53814 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMTNP53814 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMTNP53814 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMTNP53814 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMTNP53814 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMTNP53814 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMTNP53814 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMTNP53814 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMTNP53814 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMTNP53814 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMTNP53814 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMTNP53814 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMTNP53814 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMTNP53814 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMTNP53814 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMTNP53814 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMTNP53814 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMTNP53814 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMTNP53814 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMTNP53814 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMTNP53814 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMTNP53814 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMTNP53814 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMTNP53814 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMTNP53814 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMTNP53814 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMTNP53814 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMTNP53814 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMTNP53814 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMTNP53814 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMTNP53814 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMTNP53814 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMTNP53814 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMTNP53814 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMTNP53814 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMTNP53814 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMTNP53814 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMTNP53814 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMTNP53814 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMTNP53814 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMTNP53814 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMTNP53814 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMTNP53814 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMTNP53814 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMTNP53814 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMTNP53814 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMTNP53814 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMTNP53814 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMTNP53814 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMTNP53814 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMTNP53814 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMTNP53814 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMTNP53814 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMTNP53814 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMTNP53814 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMTNP53814 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMTNP53814 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMTNP53814 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMTNP53814 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms