Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFIP1P53367 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP1P53367 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms