Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF138P52744 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms