Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF140P52738 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms