Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGDP52209 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGDP52209 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGDP52209 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGDP52209 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGDP52209 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGDP52209 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGDP52209 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGDP52209 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGDP52209 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGDP52209 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGDP52209 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGDP52209 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGDP52209 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGDP52209 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGDP52209 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGDP52209 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGDP52209 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGDP52209 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PGDP52209 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGDP52209 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGDP52209 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGDP52209 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGDP52209 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PGDP52209 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGDP52209 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGDP52209 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PGDP52209 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGDP52209 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGDP52209 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGDP52209 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGDP52209 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGDP52209 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGDP52209 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGDP52209 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGDP52209 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGDP52209 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGDP52209 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGDP52209 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGDP52209 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGDP52209 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGDP52209 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGDP52209 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGDP52209 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGDP52209 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGDP52209 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGDP52209 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PGDP52209 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGDP52209 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGDP52209 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGDP52209 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGDP52209 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PGDP52209 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGDP52209 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGDP52209 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGDP52209 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGDP52209 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGDP52209 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGDP52209 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGDP52209 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGDP52209 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGDP52209 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGDP52209 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGDP52209 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGDP52209 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGDP52209 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGDP52209 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGDP52209 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGDP52209 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGDP52209 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGDP52209 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms