Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HLCSP50747 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLCSP50747 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HLCSP50747 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLCSP50747 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLCSP50747 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HLCSP50747 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLCSP50747 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLCSP50747 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLCSP50747 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLCSP50747 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLCSP50747 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLCSP50747 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLCSP50747 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HLCSP50747 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLCSP50747 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLCSP50747 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLCSP50747 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLCSP50747 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLCSP50747 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLCSP50747 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLCSP50747 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLCSP50747 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLCSP50747 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLCSP50747 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLCSP50747 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLCSP50747 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLCSP50747 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLCSP50747 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLCSP50747 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLCSP50747 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLCSP50747 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLCSP50747 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLCSP50747 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLCSP50747 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLCSP50747 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLCSP50747 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLCSP50747 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLCSP50747 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLCSP50747 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLCSP50747 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLCSP50747 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLCSP50747 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLCSP50747 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLCSP50747 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLCSP50747 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLCSP50747 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLCSP50747 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLCSP50747 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLCSP50747 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLCSP50747 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLCSP50747 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLCSP50747 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLCSP50747 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLCSP50747 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLCSP50747 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLCSP50747 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLCSP50747 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLCSP50747 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLCSP50747 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLCSP50747 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLCSP50747 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLCSP50747 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLCSP50747 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLCSP50747 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms