Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN1P49257 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN1P49257 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms