Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PXNP49023 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PXNP49023 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PXNP49023 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PXNP49023 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PXNP49023 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PXNP49023 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PXNP49023 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PXNP49023 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PXNP49023 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PXNP49023 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PXNP49023 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PXNP49023 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PXNP49023 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PXNP49023 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PXNP49023 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PXNP49023 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PXNP49023 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PXNP49023 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PXNP49023 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PXNP49023 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PXNP49023 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PXNP49023 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PXNP49023 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PXNP49023 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PXNP49023 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PXNP49023 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PXNP49023 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PXNP49023 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PXNP49023 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PXNP49023 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PXNP49023 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PXNP49023 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PXNP49023 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PXNP49023 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PXNP49023 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PXNP49023 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PXNP49023 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PXNP49023 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PXNP49023 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PXNP49023 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PXNP49023 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PXNP49023 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PXNP49023 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PXNP49023 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PXNP49023 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PXNP49023 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PXNP49023 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PXNP49023 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PXNP49023 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PXNP49023 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PXNP49023 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PXNP49023 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PXNP49023 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PXNP49023 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PXNP49023 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PXNP49023 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PXNP49023 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PXNP49023 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PXNP49023 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PXNP49023 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PXNP49023 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PXNP49023 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PXNP49023 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PXNP49023 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PXNP49023 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PXNP49023 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PXNP49023 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PXNP49023 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PXNP49023 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PXNP49023 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PXNP49023 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PXNP49023 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PXNP49023 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PXNP49023 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PXNP49023 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PXNP49023 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PXNP49023 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PXNP49023 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PXNP49023 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PXNP49023 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PXNP49023 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PXNP49023 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PXNP49023 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PXNP49023 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PXNP49023 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PXNP49023 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PXNP49023 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PXNP49023 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PXNP49023 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PXNP49023 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PXNP49023 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PXNP49023 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PXNP49023 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PXNP49023 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PXNP49023 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PXNP49023 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PXNP49023 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PXNP49023 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PXNP49023 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms