Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRB2P47870 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRB2P47870 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABRB2P47870 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms