Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYKP43405 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYKP43405 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYKP43405 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYKP43405 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYKP43405 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYKP43405 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYKP43405 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYKP43405 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYKP43405 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYKP43405 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYKP43405 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYKP43405 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYKP43405 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYKP43405 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYKP43405 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYKP43405 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYKP43405 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYKP43405 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYKP43405 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYKP43405 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYKP43405 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYKP43405 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYKP43405 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYKP43405 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYKP43405 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYKP43405 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYKP43405 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYKP43405 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYKP43405 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYKP43405 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYKP43405 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYKP43405 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYKP43405 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYKP43405 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYKP43405 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYKP43405 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYKP43405 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SYKP43405 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SYKP43405 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYKP43405 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYKP43405 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYKP43405 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYKP43405 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYKP43405 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYKP43405 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYKP43405 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYKP43405 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYKP43405 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYKP43405 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYKP43405 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYKP43405 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYKP43405 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYKP43405 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYKP43405 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYKP43405 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYKP43405 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYKP43405 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYKP43405 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYKP43405 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYKP43405 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYKP43405 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYKP43405 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYKP43405 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYKP43405 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYKP43405 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYKP43405 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYKP43405 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYKP43405 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYKP43405 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYKP43405 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYKP43405 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYKP43405 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYKP43405 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYKP43405 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYKP43405 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYKP43405 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYKP43405 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SYKP43405 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYKP43405 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYKP43405 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYKP43405 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYKP43405 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYKP43405 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYKP43405 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYKP43405 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYKP43405 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYKP43405 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYKP43405 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYKP43405 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYKP43405 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYKP43405 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYKP43405 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYKP43405 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SYKP43405 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYKP43405 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYKP43405 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYKP43405 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYKP43405 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYKP43405 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms