Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD13P35453 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD13P35453 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD13P35453 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms