Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF2P35227 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms