Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC1P35052 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC1P35052 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC1P35052 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC1P35052 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC1P35052 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC1P35052 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC1P35052 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPC1P35052 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC1P35052 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC1P35052 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC1P35052 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC1P35052 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC1P35052 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC1P35052 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC1P35052 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC1P35052 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC1P35052 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC1P35052 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPC1P35052 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC1P35052 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC1P35052 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC1P35052 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC1P35052 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC1P35052 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC1P35052 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC1P35052 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPC1P35052 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC1P35052 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC1P35052 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC1P35052 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC1P35052 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC1P35052 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC1P35052 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC1P35052 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC1P35052 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC1P35052 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC1P35052 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPC1P35052 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPC1P35052 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC1P35052 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC1P35052 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC1P35052 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC1P35052 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC1P35052 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC1P35052 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC1P35052 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC1P35052 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC1P35052 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC1P35052 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC1P35052 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC1P35052 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC1P35052 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC1P35052 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC1P35052 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC1P35052 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC1P35052 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC1P35052 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC1P35052 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC1P35052 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC1P35052 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC1P35052 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC1P35052 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC1P35052 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC1P35052 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms