Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSG3P32926 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSG3P32926 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSG3P32926 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSG3P32926 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG3P32926 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG3P32926 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG3P32926 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG3P32926 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG3P32926 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG3P32926 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG3P32926 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG3P32926 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG3P32926 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG3P32926 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG3P32926 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG3P32926 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG3P32926 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG3P32926 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG3P32926 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG3P32926 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG3P32926 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG3P32926 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DSG3P32926 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DSG3P32926 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DSG3P32926 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG3P32926 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG3P32926 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG3P32926 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG3P32926 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG3P32926 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG3P32926 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG3P32926 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSG3P32926 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSG3P32926 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSG3P32926 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DSG3P32926 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSG3P32926 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSG3P32926 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSG3P32926 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG3P32926 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG3P32926 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG3P32926 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG3P32926 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DSG3P32926 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DSG3P32926 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DSG3P32926 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DSG3P32926 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DSG3P32926 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG3P32926 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG3P32926 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG3P32926 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG3P32926 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG3P32926 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG3P32926 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DSG3P32926 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DSG3P32926 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DSG3P32926 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG3P32926 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG3P32926 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG3P32926 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG3P32926 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG3P32926 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG3P32926 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG3P32926 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG3P32926 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DSG3P32926 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DSG3P32926 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG3P32926 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG3P32926 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG3P32926 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG3P32926 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG3P32926 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG3P32926 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG3P32926 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG3P32926 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG3P32926 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG3P32926 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG3P32926 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG3P32926 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG3P32926 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG3P32926 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG3P32926 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG3P32926 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG3P32926 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG3P32926 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG3P32926 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 599.3 ms