Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP2P32456 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP2P32456 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP2P32456 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP2P32456 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP2P32456 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP2P32456 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP2P32456 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP2P32456 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP2P32456 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP2P32456 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP2P32456 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP2P32456 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP2P32456 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP2P32456 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP2P32456 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP2P32456 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP2P32456 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP2P32456 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP2P32456 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP2P32456 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP2P32456 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP2P32456 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP2P32456 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP2P32456 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP2P32456 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP2P32456 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP2P32456 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP2P32456 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP2P32456 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP2P32456 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP2P32456 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP2P32456 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP2P32456 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP2P32456 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP2P32456 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP2P32456 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP2P32456 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP2P32456 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP2P32456 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP2P32456 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP2P32456 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP2P32456 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP2P32456 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP2P32456 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP2P32456 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP2P32456 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP2P32456 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP2P32456 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GBP2P32456 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GBP2P32456 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GBP2P32456 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GBP2P32456 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GBP2P32456 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP2P32456 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP2P32456 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP2P32456 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP2P32456 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP2P32456 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP2P32456 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP2P32456 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP2P32456 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP2P32456 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP2P32456 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP2P32456 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP2P32456 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP2P32456 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP2P32456 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP2P32456 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP2P32456 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP2P32456 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP2P32456 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP2P32456 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP2P32456 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms