Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC8A1P32418 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms