Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCKBRP32239 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms