Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGA1P29973 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGA1P29973 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA1P29973 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.3 ms