Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTFP26441 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTFP26441 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTFP26441 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTFP26441 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTFP26441 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTFP26441 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTFP26441 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTFP26441 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTFP26441 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTFP26441 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTFP26441 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTFP26441 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTFP26441 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTFP26441 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTFP26441 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTFP26441 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTFP26441 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTFP26441 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTFP26441 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTFP26441 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTFP26441 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTFP26441 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTFP26441 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTFP26441 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTFP26441 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTFP26441 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTFP26441 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTFP26441 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTFP26441 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTFP26441 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTFP26441 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTFP26441 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTFP26441 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTFP26441 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTFP26441 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTFP26441 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTFP26441 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTFP26441 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTFP26441 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTFP26441 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTFP26441 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTFP26441 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTFP26441 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTFP26441 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTFP26441 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTFP26441 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTFP26441 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms