Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMLP26374 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMLP26374 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMLP26374 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMLP26374 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMLP26374 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMLP26374 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMLP26374 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMLP26374 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMLP26374 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMLP26374 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMLP26374 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMLP26374 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMLP26374 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMLP26374 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMLP26374 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMLP26374 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMLP26374 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMLP26374 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMLP26374 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMLP26374 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMLP26374 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMLP26374 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMLP26374 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMLP26374 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMLP26374 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMLP26374 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMLP26374 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMLP26374 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMLP26374 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMLP26374 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMLP26374 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMLP26374 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMLP26374 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMLP26374 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMLP26374 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMLP26374 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMLP26374 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMLP26374 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMLP26374 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMLP26374 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMLP26374 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMLP26374 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMLP26374 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMLP26374 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMLP26374 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMLP26374 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMLP26374 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMLP26374 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMLP26374 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMLP26374 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMLP26374 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMLP26374 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMLP26374 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMLP26374 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMLP26374 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMLP26374 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMLP26374 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMLP26374 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMLP26374 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMLP26374 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMLP26374 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMLP26374 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMLP26374 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMLP26374 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMLP26374 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMLP26374 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMLP26374 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMLP26374 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMLP26374 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMLP26374 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMLP26374 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMLP26374 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMLP26374 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMLP26374 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMLP26374 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMLP26374 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMLP26374 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms