Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLDCP23378 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLDCP23378 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLDCP23378 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLDCP23378 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLDCP23378 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLDCP23378 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GLDCP23378 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GLDCP23378 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GLDCP23378 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GLDCP23378 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLDCP23378 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLDCP23378 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLDCP23378 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLDCP23378 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLDCP23378 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLDCP23378 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLDCP23378 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLDCP23378 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLDCP23378 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLDCP23378 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLDCP23378 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GLDCP23378 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLDCP23378 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GLDCP23378 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLDCP23378 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLDCP23378 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GLDCP23378 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GLDCP23378 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GLDCP23378 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLDCP23378 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLDCP23378 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLDCP23378 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLDCP23378 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLDCP23378 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLDCP23378 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLDCP23378 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLDCP23378 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLDCP23378 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLDCP23378 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLDCP23378 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLDCP23378 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLDCP23378 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLDCP23378 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLDCP23378 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLDCP23378 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLDCP23378 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLDCP23378 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLDCP23378 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLDCP23378 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLDCP23378 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLDCP23378 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLDCP23378 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLDCP23378 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLDCP23378 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLDCP23378 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLDCP23378 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLDCP23378 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLDCP23378 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLDCP23378 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLDCP23378 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLDCP23378 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLDCP23378 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLDCP23378 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLDCP23378 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GLDCP23378 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLDCP23378 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLDCP23378 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLDCP23378 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLDCP23378 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLDCP23378 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GLDCP23378 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLDCP23378 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLDCP23378 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLDCP23378 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLDCP23378 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLDCP23378 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLDCP23378 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLDCP23378 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLDCP23378 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLDCP23378 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLDCP23378 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLDCP23378 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLDCP23378 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLDCP23378 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLDCP23378 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms