Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTNP21246 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTNP21246 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTNP21246 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTNP21246 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTNP21246 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTNP21246 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTNP21246 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTNP21246 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTNP21246 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTNP21246 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTNP21246 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTNP21246 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTNP21246 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTNP21246 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTNP21246 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTNP21246 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTNP21246 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTNP21246 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTNP21246 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTNP21246 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTNP21246 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTNP21246 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTNP21246 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTNP21246 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTNP21246 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTNP21246 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTNP21246 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTNP21246 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTNP21246 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTNP21246 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTNP21246 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTNP21246 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTNP21246 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTNP21246 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTNP21246 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTNP21246 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTNP21246 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTNP21246 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTNP21246 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTNP21246 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTNP21246 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTNP21246 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTNP21246 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTNP21246 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTNP21246 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTNP21246 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTNP21246 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTNP21246 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTNP21246 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTNP21246 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTNP21246 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTNP21246 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTNP21246 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTNP21246 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTNP21246 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms