Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD247P20963 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD247P20963 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD247P20963 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD247P20963 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD247P20963 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD247P20963 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD247P20963 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD247P20963 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD247P20963 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD247P20963 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD247P20963 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD247P20963 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD247P20963 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD247P20963 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD247P20963 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD247P20963 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD247P20963 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD247P20963 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD247P20963 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD247P20963 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD247P20963 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD247P20963 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CD247P20963 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD247P20963 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD247P20963 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD247P20963 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD247P20963 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD247P20963 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD247P20963 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD247P20963 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD247P20963 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD247P20963 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CD247P20963 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD247P20963 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD247P20963 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD247P20963 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD247P20963 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD247P20963 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD247P20963 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD247P20963 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD247P20963 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD247P20963 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD247P20963 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD247P20963 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD247P20963 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD247P20963 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD247P20963 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD247P20963 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD247P20963 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD247P20963 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD247P20963 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD247P20963 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD247P20963 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD247P20963 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD247P20963 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms