Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB4AP20338 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB4AP20338 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms