Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNA2P20248 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNA2P20248 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms