Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF2P19878 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF2P19878 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF2P19878 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF2P19878 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF2P19878 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCF2P19878 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF2P19878 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF2P19878 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF2P19878 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF2P19878 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF2P19878 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF2P19878 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF2P19878 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF2P19878 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCF2P19878 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF2P19878 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF2P19878 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF2P19878 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF2P19878 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF2P19878 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF2P19878 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCF2P19878 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF2P19878 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF2P19878 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF2P19878 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF2P19878 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF2P19878 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF2P19878 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCF2P19878 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF2P19878 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF2P19878 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF2P19878 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF2P19878 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF2P19878 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF2P19878 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF2P19878 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF2P19878 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF2P19878 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCF2P19878 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF2P19878 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF2P19878 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF2P19878 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF2P19878 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF2P19878 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF2P19878 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF2P19878 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCF2P19878 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF2P19878 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF2P19878 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF2P19878 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF2P19878 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF2P19878 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF2P19878 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF2P19878 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF2P19878 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF2P19878 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF2P19878 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF2P19878 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF2P19878 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF2P19878 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF2P19878 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF2P19878 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF2P19878 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF2P19878 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF2P19878 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF2P19878 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF2P19878 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF2P19878 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF2P19878 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF2P19878 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF2P19878 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF2P19878 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF2P19878 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF2P19878 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF2P19878 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF2P19878 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms