Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFE3P19532 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFE3P19532 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFE3P19532 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFE3P19532 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFE3P19532 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFE3P19532 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFE3P19532 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFE3P19532 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFE3P19532 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFE3P19532 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFE3P19532 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFE3P19532 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFE3P19532 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFE3P19532 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFE3P19532 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TFE3P19532 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFE3P19532 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFE3P19532 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TFE3P19532 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFE3P19532 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFE3P19532 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFE3P19532 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFE3P19532 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFE3P19532 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFE3P19532 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFE3P19532 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFE3P19532 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFE3P19532 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFE3P19532 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFE3P19532 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFE3P19532 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFE3P19532 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFE3P19532 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFE3P19532 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TFE3P19532 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFE3P19532 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFE3P19532 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFE3P19532 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFE3P19532 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TFE3P19532 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFE3P19532 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFE3P19532 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFE3P19532 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFE3P19532 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFE3P19532 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFE3P19532 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFE3P19532 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFE3P19532 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFE3P19532 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFE3P19532 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFE3P19532 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFE3P19532 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFE3P19532 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFE3P19532 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFE3P19532 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFE3P19532 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFE3P19532 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFE3P19532 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFE3P19532 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFE3P19532 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFE3P19532 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFE3P19532 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFE3P19532 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFE3P19532 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFE3P19532 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFE3P19532 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFE3P19532 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFE3P19532 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFE3P19532 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFE3P19532 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFE3P19532 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFE3P19532 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFE3P19532 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFE3P19532 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TFE3P19532 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFE3P19532 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms