Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT15P19012 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT15P19012 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT15P19012 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT15P19012 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT15P19012 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT15P19012 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT15P19012 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT15P19012 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT15P19012 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT15P19012 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT15P19012 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT15P19012 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT15P19012 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT15P19012 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT15P19012 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT15P19012 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT15P19012 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT15P19012 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT15P19012 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT15P19012 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT15P19012 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT15P19012 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT15P19012 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT15P19012 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT15P19012 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT15P19012 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT15P19012 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT15P19012 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT15P19012 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT15P19012 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT15P19012 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT15P19012 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT15P19012 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT15P19012 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT15P19012 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT15P19012 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT15P19012 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT15P19012 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT15P19012 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT15P19012 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT15P19012 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT15P19012 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT15P19012 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT15P19012 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT15P19012 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT15P19012 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT15P19012 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT15P19012 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT15P19012 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT15P19012 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT15P19012 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT15P19012 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT15P19012 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT15P19012 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT15P19012 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT15P19012 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT15P19012 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT15P19012 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT15P19012 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT15P19012 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT15P19012 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT15P19012 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT15P19012 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT15P19012 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms