Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSP16219 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSP16219 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSP16219 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSP16219 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACADSP16219 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSP16219 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSP16219 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSP16219 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSP16219 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSP16219 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSP16219 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSP16219 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSP16219 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSP16219 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACADSP16219 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSP16219 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSP16219 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSP16219 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSP16219 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSP16219 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSP16219 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSP16219 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSP16219 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACADSP16219 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACADSP16219 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACADSP16219 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACADSP16219 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACADSP16219 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACADSP16219 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ACADSP16219 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACADSP16219 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACADSP16219 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACADSP16219 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACADSP16219 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSP16219 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSP16219 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSP16219 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSP16219 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSP16219 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSP16219 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSP16219 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSP16219 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSP16219 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACADSP16219 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSP16219 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSP16219 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSP16219 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSP16219 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSP16219 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSP16219 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSP16219 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSP16219 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSP16219 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSP16219 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSP16219 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSP16219 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSP16219 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSP16219 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSP16219 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSP16219 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSP16219 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSP16219 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSP16219 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSP16219 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSP16219 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSP16219 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSP16219 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSP16219 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSP16219 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSP16219 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSP16219 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSP16219 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSP16219 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSP16219 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSP16219 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms