Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV1P15498 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV1P15498 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV1P15498 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV1P15498 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV1P15498 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV1P15498 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV1P15498 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV1P15498 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV1P15498 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV1P15498 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV1P15498 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV1P15498 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV1P15498 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV1P15498 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV1P15498 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV1P15498 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV1P15498 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV1P15498 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV1P15498 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV1P15498 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV1P15498 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV1P15498 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV1P15498 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV1P15498 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV1P15498 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV1P15498 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV1P15498 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV1P15498 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV1P15498 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV1P15498 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV1P15498 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV1P15498 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV1P15498 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV1P15498 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV1P15498 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV1P15498 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAV1P15498 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAV1P15498 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAV1P15498 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAV1P15498 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAV1P15498 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAV1P15498 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAV1P15498 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAV1P15498 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAV1P15498 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAV1P15498 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAV1P15498 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAV1P15498 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VAV1P15498 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAV1P15498 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAV1P15498 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAV1P15498 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAV1P15498 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAV1P15498 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAV1P15498 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAV1P15498 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAV1P15498 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAV1P15498 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VAV1P15498 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAV1P15498 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAV1P15498 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAV1P15498 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAV1P15498 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAV1P15498 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VAV1P15498 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAV1P15498 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAV1P15498 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAV1P15498 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAV1P15498 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAV1P15498 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VAV1P15498 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAV1P15498 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAV1P15498 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAV1P15498 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAV1P15498 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAV1P15498 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAV1P15498 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAV1P15498 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VAV1P15498 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAV1P15498 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAV1P15498 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VAV1P15498 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VAV1P15498 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAV1P15498 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAV1P15498 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms