Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM27P14373 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM27P14373 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms