Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRG2P13727 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG2P13727 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG2P13727 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG2P13727 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRG2P13727 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRG2P13727 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRG2P13727 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG2P13727 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRG2P13727 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRG2P13727 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRG2P13727 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRG2P13727 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRG2P13727 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRG2P13727 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRG2P13727 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRG2P13727 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRG2P13727 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRG2P13727 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRG2P13727 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRG2P13727 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRG2P13727 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRG2P13727 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRG2P13727 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRG2P13727 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRG2P13727 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRG2P13727 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRG2P13727 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRG2P13727 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRG2P13727 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRG2P13727 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRG2P13727 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRG2P13727 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRG2P13727 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRG2P13727 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRG2P13727 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRG2P13727 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRG2P13727 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRG2P13727 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRG2P13727 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRG2P13727 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRG2P13727 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRG2P13727 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRG2P13727 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRG2P13727 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRG2P13727 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRG2P13727 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRG2P13727 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRG2P13727 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRG2P13727 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRG2P13727 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRG2P13727 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRG2P13727 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRG2P13727 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRG2P13727 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms