Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA4P13612 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms