Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I1P13073 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms