Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH1P12830 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH1P12830 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH1P12830 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH1P12830 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH1P12830 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH1P12830 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH1P12830 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH1P12830 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH1P12830 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH1P12830 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH1P12830 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH1P12830 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH1P12830 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH1P12830 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH1P12830 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH1P12830 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH1P12830 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH1P12830 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH1P12830 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH1P12830 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH1P12830 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH1P12830 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH1P12830 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH1P12830 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH1P12830 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH1P12830 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH1P12830 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH1P12830 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH1P12830 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH1P12830 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH1P12830 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH1P12830 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH1P12830 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH1P12830 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH1P12830 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH1P12830 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH1P12830 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH1P12830 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH1P12830 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH1P12830 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH1P12830 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH1P12830 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH1P12830 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH1P12830 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH1P12830 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH1P12830 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH1P12830 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH1P12830 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH1P12830 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH1P12830 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH1P12830 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH1P12830 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH1P12830 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH1P12830 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH1P12830 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH1P12830 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH1P12830 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH1P12830 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH1P12830 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH1P12830 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH1P12830 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH1P12830 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH1P12830 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH1P12830 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH1P12830 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH1P12830 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH1P12830 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH1P12830 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH1P12830 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH1P12830 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH1P12830 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH1P12830 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH1P12830 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH1P12830 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH1P12830 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH1P12830 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH1P12830 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH1P12830 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH1P12830 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH1P12830 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH1P12830 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH1P12830 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH1P12830 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH1P12830 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH1P12830 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH1P12830 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms