Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41P11171 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41P11171 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41P11171 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41P11171 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41P11171 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41P11171 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41P11171 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41P11171 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41P11171 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41P11171 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41P11171 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41P11171 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41P11171 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41P11171 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41P11171 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41P11171 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41P11171 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41P11171 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41P11171 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41P11171 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41P11171 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41P11171 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41P11171 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41P11171 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41P11171 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41P11171 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB41P11171 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB41P11171 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB41P11171 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB41P11171 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB41P11171 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB41P11171 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB41P11171 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB41P11171 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41P11171 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41P11171 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41P11171 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41P11171 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41P11171 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41P11171 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41P11171 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41P11171 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41P11171 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41P11171 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41P11171 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41P11171 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41P11171 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41P11171 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41P11171 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41P11171 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41P11171 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41P11171 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41P11171 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41P11171 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41P11171 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41P11171 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41P11171 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41P11171 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41P11171 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41P11171 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41P11171 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41P11171 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41P11171 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41P11171 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41P11171 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41P11171 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41P11171 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41P11171 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41P11171 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41P11171 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41P11171 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41P11171 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41P11171 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41P11171 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41P11171 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms