Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00032P0C843 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00032P0C843 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms