Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD48P09326 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD48P09326 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD48P09326 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD48P09326 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD48P09326 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD48P09326 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD48P09326 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD48P09326 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD48P09326 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD48P09326 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD48P09326 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD48P09326 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD48P09326 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD48P09326 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD48P09326 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD48P09326 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD48P09326 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD48P09326 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD48P09326 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD48P09326 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD48P09326 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD48P09326 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CD48P09326 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD48P09326 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD48P09326 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CD48P09326 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD48P09326 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD48P09326 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD48P09326 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD48P09326 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD48P09326 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD48P09326 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD48P09326 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD48P09326 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD48P09326 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD48P09326 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD48P09326 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD48P09326 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD48P09326 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD48P09326 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD48P09326 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD48P09326 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD48P09326 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD48P09326 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD48P09326 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD48P09326 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD48P09326 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD48P09326 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD48P09326 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD48P09326 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD48P09326 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD48P09326 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD48P09326 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD48P09326 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD48P09326 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD48P09326 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD48P09326 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD48P09326 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD48P09326 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD48P09326 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD48P09326 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD48P09326 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD48P09326 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD48P09326 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD48P09326 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD48P09326 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD48P09326 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD48P09326 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD48P09326 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD48P09326 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD48P09326 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CD48P09326 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD48P09326 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD48P09326 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD48P09326 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD48P09326 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD48P09326 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD48P09326 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD48P09326 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD48P09326 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD48P09326 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD48P09326 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms